55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1044 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  100 
 
 		 550 aa  1083    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  88.83 
 
 		 546 aa  962    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  94.69 
 
 		 546 aa  1016    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  97.44 
 
 		 546 aa  1044    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 		 585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  25.42 
 
 		 586 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.34 
 
 		 564 aa  130  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  26.03 
 
 		 559 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  26.12 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  25.59 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  24.09 
 
 		 587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  25.11 
 
 		 565 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  26.52 
 
 		 583 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  24.14 
 
 		 600 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  26.1 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 580 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.69 
 
 		 592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.35 
 
 		 580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  24.61 
 
 		 553 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  24.91 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  23.94 
 
 		 577 aa  110  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  22.86 
 
 		 577 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  23.84 
 
 		 576 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.73 
 
 		 578 aa  108  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.67 
 
 		 576 aa  107  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  23.21 
 
 		 636 aa  107  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  24.77 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  25.41 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  24.46 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  23.08 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  25.56 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  25.79 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  26.42 
 
 		 571 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  26.42 
 
 		 570 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  25.2 
 
 		 578 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  25.41 
 
 		 573 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  25.67 
 
 		 571 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  23.58 
 
 		 565 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  24.72 
 
 		 565 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  23.47 
 
 		 596 aa  94.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.11 
 
 		 568 aa  90.5  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 		 581 aa  90.1  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  20.93 
 
 		 579 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  24.24 
 
 		 603 aa  87.4  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  24.58 
 
 		 572 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  23.19 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  24.86 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  22.52 
 
 		 577 aa  53.5  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.45 
 
 		 508 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  21.38 
 
 		 481 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  24.04 
 
 		 594 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.1 
 
 		 479 aa  47  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  21.43 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1174  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 645 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00165263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>