More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1224 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  90.74 
 
 
583 aa  1103    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  62.09 
 
 
592 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  60.85 
 
 
586 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  82.79 
 
 
581 aa  1007    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  60.38 
 
 
581 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  82.27 
 
 
580 aa  999    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  58.15 
 
 
580 aa  680    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  61.39 
 
 
577 aa  718    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  98.46 
 
 
583 aa  1183    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  97.26 
 
 
583 aa  1172    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  82.79 
 
 
581 aa  1007    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  59.38 
 
 
578 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  84.19 
 
 
581 aa  1021    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  100 
 
 
583 aa  1199    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  83.13 
 
 
581 aa  1010    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  57.61 
 
 
573 aa  690    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  44.25 
 
 
580 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  42.68 
 
 
585 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  42.14 
 
 
578 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  39.54 
 
 
579 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  32.22 
 
 
664 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  29.53 
 
 
529 aa  220  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.93 
 
 
523 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.74 
 
 
523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  31.01 
 
 
581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  28.17 
 
 
526 aa  211  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  29.23 
 
 
558 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.53 
 
 
663 aa  206  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  27.65 
 
 
663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.85 
 
 
638 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.45 
 
 
607 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  27.86 
 
 
625 aa  200  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.84 
 
 
607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.04 
 
 
533 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.65 
 
 
601 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.64 
 
 
627 aa  193  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.36 
 
 
555 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  28.15 
 
 
532 aa  187  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.94 
 
 
605 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.99 
 
 
591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.17 
 
 
657 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.77 
 
 
584 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.65 
 
 
659 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  25.69 
 
 
637 aa  177  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  25.75 
 
 
637 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.94 
 
 
587 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.35 
 
 
672 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.71 
 
 
520 aa  171  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  25.09 
 
 
641 aa  170  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.27 
 
 
504 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 
582 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  25.84 
 
 
619 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.42 
 
 
508 aa  128  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.89 
 
 
523 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.85 
 
 
489 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  23.36 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.84 
 
 
517 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.16 
 
 
1215 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.72 
 
 
509 aa  99.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.68 
 
 
1202 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  23.56 
 
 
504 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  33.98 
 
 
315 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.23 
 
 
1284 aa  95.9  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.77 
 
 
515 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.46 
 
 
512 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  22.81 
 
 
556 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.85 
 
 
1181 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  29.13 
 
 
313 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  21.78 
 
 
533 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.4 
 
 
503 aa  87.8  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  21.67 
 
 
530 aa  87.8  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.26 
 
 
1175 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.03 
 
 
516 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
313 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  21.99 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.36 
 
 
722 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  29.75 
 
 
481 aa  84  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.97 
 
 
508 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.97 
 
 
508 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  22.02 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  20.86 
 
 
523 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  20.67 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  20.67 
 
 
520 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  20.67 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.29 
 
 
520 aa  77  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.92 
 
 
491 aa  77  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1253  metallophosphoesterase  25 
 
 
392 aa  77  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00126646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2912  metallophosphoesterase  25.66 
 
 
463 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
638 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  19.8 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1194  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  29.59 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000521258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  23.01 
 
 
597 aa  74.7  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.13 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  20.84 
 
 
529 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  20.84 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  21.11 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  19.6 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  19.6 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>