More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1427 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  100 
 
 		 581 aa  1196    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  72.34 
 
 		 577 aa  860    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  60.03 
 
 		 583 aa  722    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  60.52 
 
 		 580 aa  730    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.41 
 
 		 581 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  62.91 
 
 		 592 aa  766    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  57.63 
 
 		 580 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.34 
 
 		 581 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  60.03 
 
 		 583 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  64.33 
 
 		 586 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  60.21 
 
 		 583 aa  717    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  58.8 
 
 		 578 aa  689    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  59.83 
 
 		 581 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  60.38 
 
 		 583 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.83 
 
 		 581 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  57.37 
 
 		 573 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  42.36 
 
 		 580 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  42.08 
 
 		 579 aa  445  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  41.92 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  40.71 
 
 		 578 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  32.21 
 
 		 664 aa  276  9e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.66 
 
 		 607 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  28.34 
 
 		 663 aa  211  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  28.75 
 
 		 526 aa  210  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  28.82 
 
 		 625 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 601 aa  207  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  28.47 
 
 		 638 aa  203  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.97 
 
 		 627 aa  203  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29.41 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.73 
 
 		 529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  28.42 
 
 		 663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.87 
 
 		 523 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.06 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.01 
 
 		 523 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.96 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.29 
 
 		 558 aa  194  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.42 
 
 		 555 aa  193  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  29.06 
 
 		 532 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  25.7 
 
 		 637 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.59 
 
 		 659 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.41 
 
 		 657 aa  186  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.01 
 
 		 591 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.98 
 
 		 607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  25.53 
 
 		 637 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.83 
 
 		 672 aa  180  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 605 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  24.7 
 
 		 641 aa  173  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.01 
 
 		 587 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.01 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 		 582 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.81 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.71 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  24.25 
 
 		 619 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.05 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.59 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  25.92 
 
 		 512 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.91 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.62 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.32 
 
 		 516 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  23.19 
 
 		 772 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  23.19 
 
 		 772 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.54 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.26 
 
 		 1202 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  29.76 
 
 		 313 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.9 
 
 		 1215 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.69 
 
 		 508 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.69 
 
 		 508 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  22.67 
 
 		 530 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.3 
 
 		 1284 aa  90.5  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  28.03 
 
 		 481 aa  90.5  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  23.23 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.11 
 
 		 1181 aa  88.6  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  22.42 
 
 		 504 aa  87.8  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  21.22 
 
 		 556 aa  87.4  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.78 
 
 		 592 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2912  metallophosphoesterase  24.83 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  27.03 
 
 		 302 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.54 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  28.12 
 
 		 313 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.45 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  32.54 
 
 		 315 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  25.44 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  24.02 
 
 		 564 aa  83.6  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  22.8 
 
 		 518 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  22.8 
 
 		 518 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.03 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  22.28 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  21.53 
 
 		 1175 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  27.34 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.63 
 
 		 518 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.71 
 
 		 722 aa  81.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.76 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  29.01 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  21.07 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  22.04 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  21.72 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  21.24 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  20.9 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  19.77 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>