28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0012 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0012  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1440    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0334  hypothetical protein  38.83 
 
 		 664 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1521  hypothetical protein  40.43 
 
 		 393 aa  274  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0114  hypothetical protein  36.48 
 
 		 382 aa  210  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000105969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0378  hypothetical protein  33.16 
 
 		 292 aa  76.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  31.11 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  23.28 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1842  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1687  lysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1665  lysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0923  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1456  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0737  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.990238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0426  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.718442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2637  LysM domain-containing protein  27.56 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  27.68 
 
 		 548 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  30.4 
 
 		 559 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  27.45 
 
 		 591 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  29.6 
 
 		 559 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.51 
 
 		 484 aa  51.6  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  25.81 
 
 		 453 aa  50.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  25.81 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  25.9 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  25.18 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  28.68 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  25.9 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>