17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0473 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0473  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.408859  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0582  hypothetical protein  37.4 
 
 
463 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000319564  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  28.65 
 
 
586 aa  56.6  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1169  peptidoglycan-binding LysM  28.46 
 
 
554 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000824633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0941  peptidoglycan-binding LysM  28.68 
 
 
359 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.984882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  30.82 
 
 
591 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 
548 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  30.3 
 
 
484 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6062  hypothetical protein  32.85 
 
 
434 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1070  hypothetical protein  31.46 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.33 
 
 
317 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  30.34 
 
 
568 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11650  hypothetical protein  30.34 
 
 
333 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  30.13 
 
 
379 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1127  hypothetical protein  27.59 
 
 
410 aa  42.4  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0038  putative periplasmic protein  27.12 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0958409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>