43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0017 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  71.98 
 
 		 545 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1212    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  35.7 
 
 		 507 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  38.13 
 
 		 508 aa  291  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  36.36 
 
 		 497 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  33.19 
 
 		 481 aa  209  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  30.29 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  30.21 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  29.88 
 
 		 495 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  30.67 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  33.98 
 
 		 253 aa  154  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  39.57 
 
 		 243 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  27.15 
 
 		 601 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  36.52 
 
 		 230 aa  141  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  29.02 
 
 		 269 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  35.64 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  30.6 
 
 		 278 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  35.35 
 
 		 246 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  31.08 
 
 		 261 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  34.25 
 
 		 230 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  31.58 
 
 		 245 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  31.05 
 
 		 255 aa  110  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  32.75 
 
 		 232 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  31.38 
 
 		 245 aa  107  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  28.51 
 
 		 263 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  31.67 
 
 		 244 aa  104  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  30.28 
 
 		 262 aa  103  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  33.04 
 
 		 242 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  27.45 
 
 		 261 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  25.16 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  29.96 
 
 		 244 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  28.4 
 
 		 261 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  31.65 
 
 		 244 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  31.69 
 
 		 244 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  30.21 
 
 		 244 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  30.71 
 
 		 244 aa  91.7  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  32.39 
 
 		 646 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  32.47 
 
 		 231 aa  90.1  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  29.36 
 
 		 248 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  28.31 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  30.06 
 
 		 264 aa  83.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>