49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2875 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 615 aa  1243    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.5 
 
 		 598 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  30.35 
 
 		 572 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  27.76 
 
 		 584 aa  161  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 696 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  24.92 
 
 		 575 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  27 
 
 		 662 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  26.16 
 
 		 628 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  34.06 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  35.34 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  34.91 
 
 		 547 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 		 518 aa  98.2  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  24.77 
 
 		 617 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 		 753 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  25.08 
 
 		 601 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  23.85 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.84 
 
 		 632 aa  51.2  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.06 
 
 		 631 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  25.57 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  25.95 
 
 		 624 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  50.65 
 
 		 542 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  26.72 
 
 		 626 aa  49.7  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  25.57 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  31.78 
 
 		 971 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3253  von Willebrand factor type A  23.56 
 
 		 634 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0206278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.19 
 
 		 252 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  27.2 
 
 		 619 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  23.29 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.42 
 
 		 636 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.16 
 
 		 861 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  28.08 
 
 		 592 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.26 
 
 		 635 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  24.39 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.26 
 
 		 635 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.29 
 
 		 604 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  24.43 
 
 		 607 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.59 
 
 		 637 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  23.31 
 
 		 584 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29762  hypothetical protein  43.55 
 
 		 691 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.700207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  24.06 
 
 		 582 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.38 
 
 		 647 aa  44.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  35 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.87 
 
 		 631 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.74 
 
 		 634 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  26.89 
 
 		 625 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 		 520 aa  44.3  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.91 
 
 		 632 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0674  blue (type 1) copper domain protein  34.48 
 
 		 534 aa  43.9  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>