22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2196 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4992  putative peptidoglycan-binding LysM  29.14 
 
 		 484 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.911035  normal  0.0172735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1781  hypothetical protein  27.92 
 
 		 387 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0106745  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1660  putative peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 		 484 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0342216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  26.99 
 
 		 3121 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2531  peptidoglycan-binding LysM  27.38 
 
 		 548 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2621  hypothetical protein  27.71 
 
 		 287 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.829749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1356  peptidoglycan-binding LysM  28.87 
 
 		 453 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1317  peptidoglycan-binding LysM  28.87 
 
 		 453 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 1198 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1272 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  28.65 
 
 		 1237 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1415  peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 		 453 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1437  peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 		 453 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0955  peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 		 453 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.310452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4581  peptidoglycan-binding LysM  27.84 
 
 		 453 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0994346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1878  peptidoglycan-binding LysM  27.96 
 
 		 446 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1063  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1129 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.09 
 
 		 11716 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0282  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 1381 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0299  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 		 1334 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3164  hypothetical protein  24.7 
 
 		 214 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>