9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3164 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3164  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0096  hypothetical protein  41.09 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1899  hypothetical protein  28.38 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0058  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1198 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.872531  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1272 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  27.74 
 
 		 1237 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2196  hypothetical protein  25.75 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.596477 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  25.49 
 
 		 2454 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1233  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258606  normal  0.166561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>