More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2844 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.09 
 
 		 505 aa  750    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 550 aa  1113    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 491 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 492 aa  267  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2752  histidine kinase  36.04 
 
 		 460 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0395  histidine kinase  31.78 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.268294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3250  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  36.92 
 
 		 1379 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 		 1258 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  28.61 
 
 		 468 aa  165  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  30.83 
 
 		 647 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.84 
 
 		 1258 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.63 
 
 		 517 aa  163  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 559 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1262 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  37.35 
 
 		 912 aa  160  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.14 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  32.38 
 
 		 484 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 488 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 803 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 970 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 683 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 439 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  28.36 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 653 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  34.98 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 584 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  31.88 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  29.79 
 
 		 516 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  33.87 
 
 		 584 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  34.24 
 
 		 674 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 491 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  34.45 
 
 		 490 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.6 
 
 		 679 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  35.95 
 
 		 1092 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 510 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  32.66 
 
 		 592 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 592 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 575 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.87 
 
 		 952 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 		 690 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  29.04 
 
 		 522 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 662 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  35.47 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.86 
 
 		 819 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.69 
 
 		 673 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1465 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 523 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 408 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 523 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  32.84 
 
 		 661 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  34.64 
 
 		 655 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  37.55 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 655 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  32.8 
 
 		 531 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 852 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 661 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.46 
 
 		 631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  37.99 
 
 		 458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  37.55 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2042  sensor histidine kinase  37.16 
 
 		 524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2435  histidine kinase  35.22 
 
 		 350 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 855 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 656 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.39 
 
 		 908 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 683 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  37.12 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  34.94 
 
 		 853 aa  148  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  37.12 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 630 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  37.12 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 611 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 611 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 753 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  39.62 
 
 		 611 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  37.55 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.4 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 655 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  34.89 
 
 		 737 aa  147  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 544 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  31.01 
 
 		 656 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 571 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  36.68 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 467 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>