More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6238 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 737 aa  1480    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 785 aa  344  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 777 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 777 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.39 
 
 		 784 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 819 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 754 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 799 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 797 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 797 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 797 aa  194  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 797 aa  194  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 797 aa  194  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 797 aa  194  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 797 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 795 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 759 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 794 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 795 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 795 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  29.88 
 
 		 795 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 795 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 795 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 828 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 829 aa  173  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 757 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  31.16 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  29.81 
 
 		 789 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  30.61 
 
 		 766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 854 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 776 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 584 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  38.66 
 
 		 1361 aa  114  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 958 aa  111  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 401 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1362 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.97 
 
 		 828 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  35.59 
 
 		 560 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 1029 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3196  histidine kinase  28.46 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0721667  normal  0.0151706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  33.06 
 
 		 480 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 645 aa  105  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 584 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 377 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 592 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 587 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  30.36 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1749  ATPase domain-containing protein  31.03 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 490 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  31.06 
 
 		 845 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 763 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 478 aa  101  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 371 aa  101  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 678 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  36.62 
 
 		 364 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  32.77 
 
 		 639 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 709 aa  100  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 581 aa  100  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 697 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  30.58 
 
 		 402 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 386 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  36.62 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  32.02 
 
 		 1074 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 377 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  28.68 
 
 		 406 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  33.08 
 
 		 425 aa  100  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1242  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 331 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 585 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 445 aa  99.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 514 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 365 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  32.46 
 
 		 455 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 365 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  30.5 
 
 		 407 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 365 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 365 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  36.62 
 
 		 364 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 587 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  34.53 
 
 		 356 aa  99  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  31.6 
 
 		 412 aa  99  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  36.62 
 
 		 364 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  32.41 
 
 		 416 aa  99  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.74 
 
 		 1346 aa  99  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 418 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 713 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 363 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 584 aa  99  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 460 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  29.14 
 
 		 363 aa  99  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 780 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  31.76 
 
 		 1317 aa  99  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  31.56 
 
 		 382 aa  98.2  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>