More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3924 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 436 aa  884    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.65 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.31 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5188  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.68 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262234 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 444 aa  199  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  31.71 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  29.85 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 436 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 454 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  33.98 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  30.88 
 
 		 430 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  30.88 
 
 		 430 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  29.98 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  34.53 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  29.07 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  34.85 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  30.77 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  35.66 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  35.66 
 
 		 454 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 524 aa  149  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  31.62 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3210  histidine kinase  26.65 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.625161 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  29.11 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 581 aa  140  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 469 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  33.09 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  34.98 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  33.61 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 585 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  27.76 
 
 		 469 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.29 
 
 		 486 aa  136  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  38.1 
 
 		 591 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.88 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  34.76 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  33.68 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 958 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  34.26 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 607 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  35 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 392 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 416 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  34.03 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 597 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 405 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  37.23 
 
 		 473 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  34.2 
 
 		 491 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  31.53 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  34.81 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  33.33 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  35.84 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  34.86 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  36.44 
 
 		 565 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 359 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 815 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  33.76 
 
 		 480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 587 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  34.18 
 
 		 482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  27 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  26.39 
 
 		 481 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 462 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  26.25 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  33.57 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  33.91 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  36.12 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 816 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>