More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1613 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  100 
 
 
594 aa  1230    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  34.6 
 
 
454 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
387 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  36.13 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  34.17 
 
 
1414 aa  143  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
673 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  35.29 
 
 
475 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  32.61 
 
 
588 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  33.96 
 
 
667 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
407 aa  137  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  32.76 
 
 
630 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  32.12 
 
 
432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.33 
 
 
1797 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
389 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
767 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
621 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0793237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  31.12 
 
 
448 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 
1058 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
2783 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.54 
 
 
660 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
687 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
412 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  33.19 
 
 
467 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
572 aa  117  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  28.1 
 
 
713 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
679 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0908  histidine kinase  31.23 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  31.28 
 
 
387 aa  115  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
1261 aa  115  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  32.8 
 
 
387 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
448 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  31.93 
 
 
393 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
707 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
406 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
718 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  27.54 
 
 
611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  31.89 
 
 
412 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
489 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
838 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
576 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
612 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  26.4 
 
 
377 aa  111  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  26.84 
 
 
927 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.06 
 
 
745 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
588 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  30.29 
 
 
628 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
511 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
407 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
612 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
520 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  30 
 
 
614 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
1195 aa  110  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
505 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
793 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  30.7 
 
 
721 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
581 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1501 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
592 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  27.85 
 
 
581 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
458 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  28.57 
 
 
596 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  31.71 
 
 
666 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  30.22 
 
 
337 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
662 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
835 aa  108  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
789 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
577 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  25 
 
 
426 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
650 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
1014 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
371 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
722 aa  108  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
546 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1435  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
512 aa  107  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  30.6 
 
 
446 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
695 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
453 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
626 aa  107  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
535 aa  107  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  30.89 
 
 
401 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
608 aa  107  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
784 aa  107  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  27.39 
 
 
783 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  28.85 
 
 
993 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  28.87 
 
 
1003 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
969 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
514 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  27.39 
 
 
783 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
523 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
1223 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
594 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
769 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
1131 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>