More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0762 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
630 aa  1292    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  35.68 
 
 
454 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  34.6 
 
 
433 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  30.84 
 
 
667 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  32.16 
 
 
594 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
673 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  33.19 
 
 
475 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  26.61 
 
 
621 aa  121  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
407 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  32.74 
 
 
448 aa  113  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  27.78 
 
 
588 aa  112  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  33.48 
 
 
446 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  31.73 
 
 
660 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
560 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  32.08 
 
 
666 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  29.39 
 
 
721 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
576 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0473  ATP-binding region ATPase domain protein  33.03 
 
 
719 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
388 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  31.98 
 
 
1414 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  28.19 
 
 
628 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
389 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.83 
 
 
1797 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  30.12 
 
 
432 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  30.92 
 
 
387 aa  98.2  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.3 
 
 
1053 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3474  ATP-binding region ATPase domain protein  27.76 
 
 
706 aa  97.8  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  25 
 
 
614 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.7 
 
 
933 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
1120 aa  96.3  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1606  histidine kinase  29.03 
 
 
710 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
695 aa  94.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
919 aa  94  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.58 
 
 
627 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
639 aa  93.6  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3182  ATP-binding region ATPase domain protein  29.96 
 
 
705 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
604 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
936 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  27.93 
 
 
938 aa  91.3  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
717 aa  90.9  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
378 aa  90.9  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 
916 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  27.27 
 
 
372 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
1014 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  26.52 
 
 
993 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
923 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 
864 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
830 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  26.56 
 
 
393 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
566 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
932 aa  89  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
1260 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
950 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
925 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  26.29 
 
 
927 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 
899 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
500 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
708 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  26.75 
 
 
1003 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  27.12 
 
 
461 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  27.75 
 
 
852 aa  87  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
1017 aa  87  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
579 aa  87  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 
657 aa  87  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  25.98 
 
 
613 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  27.66 
 
 
896 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  28.57 
 
 
1335 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  27.31 
 
 
905 aa  86.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
745 aa  86.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  26.69 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 
815 aa  85.9  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 
713 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  24.89 
 
 
586 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  26.69 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.79 
 
 
745 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
663 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
1060 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  26.11 
 
 
710 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
636 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 
612 aa  85.1  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1007 aa  85.1  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
752 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  27.66 
 
 
925 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  26.69 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  25.8 
 
 
751 aa  84.7  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  24.89 
 
 
762 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
944 aa  84.3  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
626 aa  84.3  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 
1029 aa  84.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
1130 aa  84.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  23.44 
 
 
643 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
1068 aa  84  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 
846 aa  84  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24 
 
 
1074 aa  84  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  27.18 
 
 
1175 aa  84  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  25.26 
 
 
961 aa  84  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  27.23 
 
 
925 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  29.82 
 
 
745 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>