More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1606 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1606  histidine kinase  100 
 
 		 710 aa  1468    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.734668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 673 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  22.28 
 
 		 667 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 377 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 827 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2733  ATP-binding region ATPase domain protein  31.2 
 
 		 355 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 637 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  30.63 
 
 		 398 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  29.86 
 
 		 461 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  29.86 
 
 		 461 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  30.11 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  29.51 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3321  histidine kinase  29.37 
 
 		 444 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 839 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  30.87 
 
 		 560 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1021 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 639 aa  107  9e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 682 aa  107  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 560 aa  107  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 810 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 969 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 639 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 663 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 639 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1291 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  30.74 
 
 		 910 aa  105  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 500 aa  105  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  30.67 
 
 		 539 aa  104  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  29.14 
 
 		 461 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 1060 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.66 
 
 		 1407 aa  104  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 867 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  29.86 
 
 		 464 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  28.12 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 614 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  27.63 
 
 		 1629 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1026 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  29.13 
 
 		 475 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  27.53 
 
 		 446 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 621 aa  103  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 677 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 631 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  28.76 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  30.3 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 678 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  29.3 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 579 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 1010 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 958 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 519 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1471  ATP-binding region ATPase domain protein  31.22 
 
 		 440 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 378 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1207 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 470 aa  101  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 701 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1247  multisensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 607 aa  100  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000186928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 640 aa  100  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 620 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 549 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 628 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 933 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 608 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1808 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3684  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 580 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.896547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 899 aa  99.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 555 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  30.94 
 
 		 535 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  31.03 
 
 		 676 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 492 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2189  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 729 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.49015  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  33.47 
 
 		 378 aa  99.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 745 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  28.51 
 
 		 454 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  28.4 
 
 		 357 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 856 aa  99  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  27.31 
 
 		 613 aa  98.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 885 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 969 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 729 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 613 aa  98.2  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1070 aa  98.2  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 928 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0404  histidine kinase  29.46 
 
 		 466 aa  98.2  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 581 aa  98.2  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 701 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 1014 aa  97.8  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 387 aa  97.8  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 874 aa  97.8  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 844 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1900  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1057 aa  97.4  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0473  ATP-binding region ATPase domain protein  31.39 
 
 		 719 aa  97.8  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 511 aa  97.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 844 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  29.71 
 
 		 412 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>