More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6422 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  100 
 
 		 432 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6423  histidine kinase  78.12 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  38.06 
 
 		 588 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  29.59 
 
 		 666 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  34.4 
 
 		 1414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  32.71 
 
 		 594 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  35.39 
 
 		 475 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  35.47 
 
 		 660 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  31.18 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  32.16 
 
 		 667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  29.79 
 
 		 628 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 576 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  30.03 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  26.83 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 639 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 639 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  25.86 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  29.89 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  30.62 
 
 		 614 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 641 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  29.66 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28.74 
 
 		 466 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 470 aa  99.8  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 466 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  30.12 
 
 		 630 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  24.9 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 600 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  24.9 
 
 		 357 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 505 aa  97.8  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 703 aa  96.7  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3321  histidine kinase  30.45 
 
 		 444 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000784482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.85 
 
 		 1797 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 673 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 920 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 661 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  31.94 
 
 		 863 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 479 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  28.57 
 
 		 1298 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.63 
 
 		 1348 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  28.26 
 
 		 1366 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 778 aa  93.2  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.9 
 
 		 1453 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  28.39 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 646 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 620 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 1436 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  29.81 
 
 		 994 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 633 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 1352 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 631 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 1436 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  26.12 
 
 		 1225 aa  90.5  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 686 aa  90.5  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  27.8 
 
 		 773 aa  90.1  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  26.05 
 
 		 587 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  26.05 
 
 		 587 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  24.9 
 
 		 508 aa  89.7  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  26.91 
 
 		 587 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  24.7 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 633 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 664 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 587 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  29.18 
 
 		 1392 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 		 1130 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 663 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 607 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  24.39 
 
 		 347 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  25.82 
 
 		 587 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  26.34 
 
 		 587 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  28.23 
 
 		 633 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  26.51 
 
 		 587 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  28.63 
 
 		 393 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 		 1207 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  26.51 
 
 		 587 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  30.6 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  26.61 
 
 		 587 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.68 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  24 
 
 		 351 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 620 aa  87  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 		 1119 aa  87  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>