More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1714 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  50.53 
 
 		 660 aa  640    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 666 aa  1351    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 		 782 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  23.85 
 
 		 795 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.8 
 
 		 663 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 662 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 		 662 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 802 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 662 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  23.73 
 
 		 677 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.59 
 
 		 914 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  23.62 
 
 		 668 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  27.17 
 
 		 715 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  21.55 
 
 		 914 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  23.71 
 
 		 918 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.35 
 
 		 726 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  25 
 
 		 724 aa  141  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  24.9 
 
 		 708 aa  141  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  35.12 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  23.4 
 
 		 918 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  29.59 
 
 		 432 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  33.73 
 
 		 667 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  33.6 
 
 		 454 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  25.92 
 
 		 553 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  24.9 
 
 		 707 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  36.29 
 
 		 433 aa  127  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 387 aa  123  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  27.89 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  22.67 
 
 		 1042 aa  120  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  31.09 
 
 		 588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  25.69 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  25.37 
 
 		 730 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.19 
 
 		 644 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  23.31 
 
 		 945 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  25.53 
 
 		 614 aa  110  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  32.08 
 
 		 630 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.4 
 
 		 686 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  22.35 
 
 		 716 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  30.89 
 
 		 446 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  30.9 
 
 		 594 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.5 
 
 		 867 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.45 
 
 		 1797 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  22.99 
 
 		 696 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  22.43 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 389 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 576 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.66 
 
 		 1045 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.7 
 
 		 1414 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  21.82 
 
 		 630 aa  98.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  25.25 
 
 		 629 aa  98.2  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1062  diguanylate cyclase  25.12 
 
 		 566 aa  97.4  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0191664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  20.24 
 
 		 696 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  24.44 
 
 		 646 aa  95.1  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  24.94 
 
 		 611 aa  94.4  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  23.35 
 
 		 565 aa  94.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  27.82 
 
 		 721 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  24.23 
 
 		 636 aa  92.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  22.97 
 
 		 651 aa  92  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  26.07 
 
 		 1346 aa  91.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  22.48 
 
 		 600 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  25.06 
 
 		 564 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.87 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 406 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  27.11 
 
 		 582 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  25.7 
 
 		 638 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 		 1182 aa  87.8  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0190  histidine kinase  26.88 
 
 		 472 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.393808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.46 
 
 		 853 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  23.57 
 
 		 636 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  24.81 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  21.31 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 639 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 640 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  29.06 
 
 		 628 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 639 aa  84  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  33.04 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  27.39 
 
 		 391 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  28.06 
 
 		 984 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  27.39 
 
 		 391 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 920 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 919 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0223  sensor histidine kinase  22.34 
 
 		 655 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.142406  normal  0.0289163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 680 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0838  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  26.59 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 		 827 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  23 
 
 		 576 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 		 1058 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  24.08 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  25.78 
 
 		 531 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  26.15 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  27.56 
 
 		 1392 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>