More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0190 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0190  histidine kinase  100 
 
 		 472 aa  965    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.393808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.79 
 
 		 1414 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  27.88 
 
 		 667 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5276  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 595 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00296366  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1714  ATP-binding region ATPase domain protein  26.88 
 
 		 666 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84327  hitchhiker  0.000293695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  27.47 
 
 		 614 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  28.28 
 
 		 594 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 576 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  25.33 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  27.57 
 
 		 660 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  26.18 
 
 		 588 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.97 
 
 		 1797 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  34.03 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 1038 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  27.55 
 
 		 628 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0095  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 582 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3684  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 580 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.896547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 597 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3058  phage head-tail adaptor, putative  28.91 
 
 		 580 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00943131  normal  0.0427518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  24.81 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 581 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 		 1143 aa  93.6  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4666  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 578 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 		 628 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  27.82 
 
 		 475 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1158 aa  92  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.39 
 
 		 614 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  26.8 
 
 		 387 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  27.64 
 
 		 908 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  25.3 
 
 		 491 aa  90.9  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 1046 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4375  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 550 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  27.59 
 
 		 372 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  25.4 
 
 		 508 aa  90.9  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24 
 
 		 455 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 468 aa  90.1  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 426 aa  90.1  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  27.73 
 
 		 957 aa  90.1  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 785 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 662 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  26.28 
 
 		 1147 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2193  histidine kinase  25.58 
 
 		 1035 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1667  histidine kinase  26.58 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0824698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 1155 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 858 aa  88.2  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  26.65 
 
 		 628 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 1155 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 1171 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 679 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  23.68 
 
 		 721 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 		 507 aa  87  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  27.8 
 
 		 833 aa  87  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 1029 aa  86.7  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.2 
 
 		 468 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.45 
 
 		 760 aa  86.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 556 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 1141 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 645 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06169  histidine kinase  24.03 
 
 		 1225 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  23.7 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3120  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 		 752 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  27.82 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  23.28 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1350 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  25.73 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  23.28 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  25.08 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  26.69 
 
 		 881 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 1168 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  25.63 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  28.16 
 
 		 606 aa  84  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  29.84 
 
 		 580 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1165 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  23.43 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  25 
 
 		 884 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  27.12 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 590 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  24.6 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 655 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.52 
 
 		 613 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 782 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  26.13 
 
 		 868 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>