More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5059 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5059  histidine kinase  100 
 
 
614 aa  1269    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00156812  normal  0.0126668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
576 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  28.99 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6126  histidine kinase  29.33 
 
 
628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
407 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.512504  normal  0.0507183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  27.56 
 
 
1414 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
387 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
673 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3961  histidine kinase  30.77 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321682  normal  0.0949422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5226  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
388 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3285  ATP-binding region ATPase domain protein  31.67 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.255364 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3540  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  29.54 
 
 
446 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.168985  normal  0.341625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1613  histidine kinase  30.87 
 
 
594 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000260533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0345  histidine kinase  31.38 
 
 
454 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0306383  normal  0.0156916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.42 
 
 
496 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.07 
 
 
1797 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1523  ATP-binding region ATPase domain protein  31.75 
 
 
433 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925921  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  32.6 
 
 
660 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6422  histidine kinase  30.62 
 
 
432 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
582 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
774 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3541  sensor kinase of copper sensing two-component system  27.78 
 
 
448 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0485338  normal  0.197924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
378 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
784 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  29.66 
 
 
1298 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
653 aa  97.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0762  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 
630 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
600 aa  96.3  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  26.75 
 
 
466 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
560 aa  95.5  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
458 aa  94.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
456 aa  94.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
589 aa  93.6  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
958 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6950  histidine kinase  26.59 
 
 
721 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293144  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
634 aa  92.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
770 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  25.52 
 
 
771 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  27.67 
 
 
1373 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.21 
 
 
1374 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  25.93 
 
 
466 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  25.93 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  26.34 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  26.34 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
399 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  26.34 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
773 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
763 aa  91.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1243  sensory box histidine kinase  26.29 
 
 
623 aa  91.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  26.34 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.99 
 
 
1514 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.99 
 
 
1514 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
468 aa  90.5  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
769 aa  90.9  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  26.55 
 
 
1384 aa  90.9  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  25.62 
 
 
771 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  26.91 
 
 
1018 aa  90.5  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
1043 aa  90.1  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0190  histidine kinase  27.47 
 
 
472 aa  90.5  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.393808  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  28.57 
 
 
908 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  26.47 
 
 
783 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  30.29 
 
 
572 aa  90.1  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
772 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3944  two-component sensor/regulator  27.39 
 
 
891 aa  90.1  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0305517  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  26.47 
 
 
783 aa  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
797 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
585 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
465 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11300  signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
556 aa  89.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3283  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
854 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331513  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1344  histidine kinase  22.59 
 
 
696 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.41 
 
 
775 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
722 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
795 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  24.95 
 
 
621 aa  88.6  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
566 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
556 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
528 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
723 aa  88.2  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 
884 aa  88.2  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 
818 aa  88.2  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
1038 aa  88.2  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  24.79 
 
 
773 aa  88.2  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.62 
 
 
1152 aa  87.8  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
556 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  24.89 
 
 
337 aa  87.8  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
818 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
546 aa  87.4  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  25.3 
 
 
1172 aa  87  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
581 aa  87.4  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
837 aa  87  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
458 aa  87  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
1055 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1406 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
620 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
591 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
911 aa  86.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
801 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
458 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>