More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2878 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  100 
 
 
372 aa  771    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1701  PAS sensor protein  42.62 
 
 
975 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454558  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  42.26 
 
 
713 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  30.99 
 
 
829 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1021 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  38.1 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
709 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  35.66 
 
 
1337 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
412 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
965 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
589 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
451 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
1291 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.82 
 
 
1274 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
701 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
584 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2114  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 
400 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  30.56 
 
 
613 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.25 
 
 
537 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
611 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  31.42 
 
 
957 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
619 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
592 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
584 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
590 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
697 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
621 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
725 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  30.21 
 
 
613 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  34.23 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
944 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.49 
 
 
1046 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1002 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
581 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  30.21 
 
 
613 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
640 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
754 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  30.21 
 
 
613 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  30.21 
 
 
613 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  30.21 
 
 
613 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  30.21 
 
 
613 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  30.21 
 
 
613 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
755 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
504 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  30.21 
 
 
613 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
524 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
584 aa  133  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
432 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
432 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
432 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
432 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  31.06 
 
 
531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
602 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
621 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
1319 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  32.74 
 
 
482 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
609 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
612 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  31.15 
 
 
917 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0192  ATP-binding region ATPase domain protein  33.19 
 
 
341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.1922 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 
1330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2776  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000654032  decreased coverage  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
587 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.15 
 
 
917 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  31 
 
 
501 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
799 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
816 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  32.08 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
608 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1559  phosphate regulon sensor protein PhoR  29.9 
 
 
432 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
625 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
583 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  30.24 
 
 
685 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  27.84 
 
 
470 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  31.25 
 
 
583 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
1043 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  29.01 
 
 
598 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  30.51 
 
 
595 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1792 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1771 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
657 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
933 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
763 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
587 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
763 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.91 
 
 
587 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1784 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1786 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
758 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  30.8 
 
 
535 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>