More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0829 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  54.7 
 
 		 829 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  90.19 
 
 		 818 aa  1437    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 812 aa  1645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.01 
 
 		 808 aa  1160    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  74.01 
 
 		 808 aa  1160    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6655  histidine kinase  49.85 
 
 		 688 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404692  hitchhiker  0.00000625165 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  36.6 
 
 		 830 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  37.44 
 
 		 830 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2834  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 808 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 815 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1093 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1093 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1090 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1069 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  29.48 
 
 		 948 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1091 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2366  histidine kinase  30.08 
 
 		 697 aa  230  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1029 aa  230  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  29.26 
 
 		 992 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1199 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 846 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 785 aa  220  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 678 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  34.66 
 
 		 988 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  34.66 
 
 		 1014 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  34.66 
 
 		 1032 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  26.44 
 
 		 782 aa  219  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  30.35 
 
 		 968 aa  217  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 1120 aa  214  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 1049 aa  213  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  32.5 
 
 		 566 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 604 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  33.26 
 
 		 952 aa  211  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 627 aa  210  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 717 aa  210  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1199 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  31.1 
 
 		 1209 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 907 aa  208  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  30.08 
 
 		 497 aa  207  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 817 aa  208  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 643 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.2 
 
 		 620 aa  207  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 827 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  31.41 
 
 		 1000 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 1199 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  33.05 
 
 		 1213 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  32.22 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 639 aa  204  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  34.47 
 
 		 669 aa  204  8e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  31.74 
 
 		 751 aa  204  8e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.72 
 
 		 772 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 643 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  31.23 
 
 		 641 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  34.22 
 
 		 683 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 781 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  31.07 
 
 		 755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  32.29 
 
 		 651 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 765 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 1003 aa  202  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1753  sensor protein LuxQ  30.63 
 
 		 583 aa  202  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.042622 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 631 aa  201  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1214 aa  201  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  34.15 
 
 		 1211 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1068 aa  200  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1201 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1002 aa  200  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1196 aa  200  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1101 aa  200  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1204 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1210 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1044 aa  200  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  33.67 
 
 		 810 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  32.64 
 
 		 741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 913 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 606 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 643 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1075 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1001 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1358 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  33.98 
 
 		 2051 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 631 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  32.9 
 
 		 588 aa  197  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 871 aa  197  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 823 aa  197  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 898 aa  197  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  31.28 
 
 		 651 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  32.56 
 
 		 578 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1044 aa  196  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  30.06 
 
 		 882 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 573 aa  194  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  33.69 
 
 		 1125 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.08 
 
 		 778 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.08 
 
 		 778 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1116 aa  194  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.08 
 
 		 778 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.08 
 
 		 778 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 1191 aa  194  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  30.28 
 
 		 1206 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 873 aa  193  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>