More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6655 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  49.85 
 
 		 812 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6655  histidine kinase  100 
 
 		 688 aa  1385    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404692  hitchhiker  0.00000625165 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  50.6 
 
 		 808 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.85 
 
 		 818 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.6 
 
 		 808 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  49.21 
 
 		 829 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  39.15 
 
 		 830 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  39.02 
 
 		 830 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2834  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 		 808 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 815 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1069 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  29.45 
 
 		 948 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1090 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1093 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1093 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 785 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 1014 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 1032 aa  230  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  36.65 
 
 		 988 aa  229  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 781 aa  229  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 827 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.24 
 
 		 620 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  27.69 
 
 		 782 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  35.37 
 
 		 952 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2366  histidine kinase  33.28 
 
 		 697 aa  224  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 606 aa  223  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 1199 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1011 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  33.58 
 
 		 651 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 880 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 643 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  33.84 
 
 		 651 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1091 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.73 
 
 		 968 aa  216  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 643 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 678 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 		 631 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  30.22 
 
 		 922 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1002 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 1003 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 957 aa  213  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  34.67 
 
 		 1211 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 573 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  33.92 
 
 		 641 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 882 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 633 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 643 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1210 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  33 
 
 		 669 aa  211  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  33.75 
 
 		 497 aa  210  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1199 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  32.75 
 
 		 683 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 781 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 1068 aa  208  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.38 
 
 		 772 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  29.18 
 
 		 992 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  33.5 
 
 		 641 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 643 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 601 aa  207  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 1201 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  33.93 
 
 		 751 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 878 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 962 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  34.19 
 
 		 1000 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 846 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 765 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  33.68 
 
 		 735 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.76 
 
 		 982 aa  205  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1358 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  36.01 
 
 		 1206 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.56 
 
 		 645 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 907 aa  204  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1029 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 873 aa  204  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 813 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 846 aa  203  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  35.06 
 
 		 835 aa  203  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 721 aa  203  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  32.98 
 
 		 588 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.64 
 
 		 659 aa  203  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  33.94 
 
 		 578 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 1001 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1120 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 911 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  32.73 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 969 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  36.02 
 
 		 882 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1433 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1075 aa  201  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 667 aa  200  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1948  histidine kinase  32.16 
 
 		 727 aa  200  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0644671  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 850 aa  200  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  35.51 
 
 		 1199 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1177 aa  200  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  34.55 
 
 		 1209 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1196 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  33.33 
 
 		 736 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  32.29 
 
 		 710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 879 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>