More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6654 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  54.7 
 
 		 812 aa  846    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.66 
 
 		 818 aa  848    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 829 aa  1663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.09 
 
 		 808 aa  840    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  58.09 
 
 		 808 aa  840    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6655  histidine kinase  49.21 
 
 		 688 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.404692  hitchhiker  0.00000625165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  38.01 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  37.56 
 
 		 830 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2834  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 808 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 815 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  31.38 
 
 		 948 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1093 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 		 1093 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1090 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1091 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1069 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2366  histidine kinase  30.54 
 
 		 697 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1003 aa  230  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 1002 aa  227  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  27.56 
 
 		 782 aa  225  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 678 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  30.09 
 
 		 732 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  28.8 
 
 		 992 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 1199 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 817 aa  217  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 913 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  29.46 
 
 		 968 aa  214  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  32.32 
 
 		 1213 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 901 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 1196 aa  212  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 827 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 785 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  33.63 
 
 		 1206 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 781 aa  211  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  31.03 
 
 		 1209 aa  210  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1001 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 1014 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  32.9 
 
 		 988 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 601 aa  210  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 1032 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1120 aa  210  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 717 aa  208  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1199 aa  208  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  34.05 
 
 		 952 aa  208  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 846 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  32.89 
 
 		 1211 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1029 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 765 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 907 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.72 
 
 		 751 aa  205  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1191 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1210 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  31.41 
 
 		 651 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  32.99 
 
 		 651 aa  204  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.06 
 
 		 772 aa  204  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 1049 aa  204  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 944 aa  204  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.51 
 
 		 620 aa  203  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 1070 aa  203  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1002 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3288  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 		 1032 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  33.94 
 
 		 853 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 645 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 815 aa  201  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  33.42 
 
 		 588 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 643 aa  200  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  35.01 
 
 		 735 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  33.68 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 643 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  33.42 
 
 		 1040 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1023 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 		 1433 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  31.27 
 
 		 641 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 822 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1201 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 781 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1214 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 631 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  34.75 
 
 		 741 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 882 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  30 
 
 		 497 aa  197  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  33.41 
 
 		 1215 aa  197  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 873 aa  197  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  32.13 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 721 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1195 aa  197  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 846 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1075 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 870 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  30.5 
 
 		 882 aa  196  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 633 aa  196  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0500  histidine kinase  28.82 
 
 		 922 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1313 aa  196  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1068 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  32.71 
 
 		 1212 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 631 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 530 aa  195  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3937  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 976 aa  195  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.972695  normal  0.0890412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  38.44 
 
 		 2109 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1204 aa  195  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>