More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1216 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1216  histidine kinase  100 
 
 
441 aa  877    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
464 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  33.86 
 
 
463 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  30.94 
 
 
360 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
451 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
463 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
383 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  36.61 
 
 
310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.49 
 
 
593 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
723 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  36.64 
 
 
473 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
382 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
389 aa  161  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
389 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
359 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
463 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  32.49 
 
 
464 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
466 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  29.67 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
585 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  27.91 
 
 
518 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
463 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.13 
 
 
364 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.13 
 
 
364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.23 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
582 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  32.72 
 
 
516 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.88 
 
 
512 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
518 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  30.31 
 
 
518 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.78 
 
 
467 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.78 
 
 
467 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  34.78 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  34.78 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.78 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.78 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  34.78 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
425 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.39 
 
 
467 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.12 
 
 
452 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
458 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  31.94 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.86 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  30.41 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  29.11 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  30.82 
 
 
391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
454 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  28.33 
 
 
356 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
496 aa  141  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
465 aa  140  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
459 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
554 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  36.12 
 
 
554 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
500 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
504 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
408 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
379 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
379 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
379 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
367 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  35.09 
 
 
565 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  29.02 
 
 
360 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
365 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
354 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  30.34 
 
 
466 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
585 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.64 
 
 
501 aa  136  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
364 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
470 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  26.68 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.25 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  27.14 
 
 
369 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
466 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
466 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748065  normal  0.851667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
359 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  32.13 
 
 
482 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.38 
 
 
467 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>