More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0072 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  100 
 
 		 527 aa  1062    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 977 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  39.59 
 
 		 1177 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.73 
 
 		 1765 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 1014 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 921 aa  289  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1767 aa  289  9e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 1767 aa  287  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 1767 aa  287  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.92 
 
 		 923 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 1768 aa  286  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.15 
 
 		 847 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.59 
 
 		 1763 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 816 aa  283  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 818 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 1240 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 1765 aa  281  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.47 
 
 		 1322 aa  280  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1771 aa  279  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 833 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 770 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 818 aa  277  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 1643 aa  276  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 649 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 1784 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 752 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 830 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 920 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 705 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  35.24 
 
 		 833 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 812 aa  273  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  36.93 
 
 		 650 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.08 
 
 		 1331 aa  273  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 916 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 1782 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  34.58 
 
 		 905 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.57 
 
 		 2213 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 745 aa  269  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 1267 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  35.4 
 
 		 727 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  35.05 
 
 		 828 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 782 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.81 
 
 		 1442 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 993 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  36.7 
 
 		 850 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  35.96 
 
 		 750 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1326 aa  266  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  37.76 
 
 		 778 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 914 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 991 aa  265  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 1433 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1340 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 636 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  36.21 
 
 		 918 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1398 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  36.36 
 
 		 977 aa  264  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  36.45 
 
 		 779 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  35.91 
 
 		 783 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1033 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  35.88 
 
 		 590 aa  262  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  33.21 
 
 		 1287 aa  262  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1057 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.24 
 
 		 1346 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  36.6 
 
 		 786 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1202 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.14 
 
 		 796 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.61 
 
 		 1499 aa  260  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 903 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1072 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 758 aa  259  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.08 
 
 		 852 aa  259  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 801 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 1203 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  34.11 
 
 		 896 aa  259  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 1131 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  35.36 
 
 		 925 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  35.74 
 
 		 917 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1005 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 1054 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1305 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 1251 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1245 aa  257  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.15 
 
 		 937 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  34.22 
 
 		 1030 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  35.77 
 
 		 918 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1582 aa  256  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 990 aa  256  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 909 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 754 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 1126 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 899 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.74 
 
 		 917 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3510  ATPase domain-containing protein  37.72 
 
 		 932 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  35.25 
 
 		 914 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.05 
 
 		 925 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  34.76 
 
 		 891 aa  254  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 1333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1055 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 936 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1258 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>