More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0298 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
899 aa  1853    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 
685 aa  344  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
893 aa  334  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
1064 aa  330  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1049 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1202 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  39.01 
 
 
918 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1363 aa  308  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
997 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.81 
 
 
1407 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.2 
 
 
1763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
967 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  34.62 
 
 
1390 aa  304  5.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
985 aa  303  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
1771 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1767 aa  303  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.14 
 
 
1765 aa  302  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1767 aa  302  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1767 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
929 aa  302  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1040 aa  301  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  34.54 
 
 
765 aa  300  6e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
1582 aa  300  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1398 aa  300  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1284 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
1768 aa  299  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
1820 aa  298  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.02 
 
 
1135 aa  296  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.86 
 
 
933 aa  296  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1550 aa  295  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  33.65 
 
 
891 aa  294  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  37.23 
 
 
1297 aa  293  7e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
990 aa  293  9e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
1240 aa  293  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
916 aa  293  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
833 aa  292  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
816 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  33.64 
 
 
925 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  33.52 
 
 
925 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.69 
 
 
2213 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.32 
 
 
929 aa  290  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
948 aa  290  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
914 aa  290  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.76 
 
 
923 aa  289  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.42 
 
 
932 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
835 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.42 
 
 
933 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
927 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
812 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.75 
 
 
1346 aa  288  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.15 
 
 
937 aa  288  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.06 
 
 
933 aa  288  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.06 
 
 
1442 aa  288  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.49 
 
 
1177 aa  287  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  35.99 
 
 
828 aa  288  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.24 
 
 
933 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  32.92 
 
 
917 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  35.14 
 
 
1200 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.04 
 
 
1331 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1305 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1326 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1101 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
1287 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
977 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
705 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.69 
 
 
917 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1128 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.09 
 
 
929 aa  284  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  33.27 
 
 
1683 aa  283  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
922 aa  283  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  34.52 
 
 
2035 aa  283  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1230 aa  283  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
837 aa  283  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00856937  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  33.79 
 
 
1179 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  34.54 
 
 
1322 aa  281  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
770 aa  281  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.1 
 
 
1234 aa  281  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1203 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1238 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  36.48 
 
 
914 aa  280  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1238 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
1166 aa  280  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
917 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1238 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1238 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.83 
 
 
935 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
721 aa  279  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1245 aa  279  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.33 
 
 
927 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
921 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  32.23 
 
 
932 aa  278  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.4 
 
 
1233 aa  277  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.47 
 
 
932 aa  277  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
1611 aa  277  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
946 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
917 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
916 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
720 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.01 
 
 
1053 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
1659 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>