More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3453 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
412 aa  820    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  60.49 
 
 
411 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0155  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
437 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  27.39 
 
 
542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
729 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
664 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
951 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  25.33 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
710 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08056  hypothetical protein  23.96 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
620 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
407 aa  126  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
681 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  26.39 
 
 
400 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  36.59 
 
 
494 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
973 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  26.6 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  28.36 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
821 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
810 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
639 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1089  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
409 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396361  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
626 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
409 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
817 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  33.88 
 
 
378 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  32.75 
 
 
387 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
786 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  24.36 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  33.74 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
792 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
767 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
810 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
883 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
779 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
769 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
789 aa  116  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
775 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
960 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
1532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
1195 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
758 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  32.94 
 
 
762 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
770 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
1267 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5440  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.2 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235159  normal  0.434516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
628 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
368 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.12 
 
 
921 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
793 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.13 
 
 
662 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
1064 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  33.07 
 
 
776 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.33 
 
 
442 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
838 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
620 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
642 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
758 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
653 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
1043 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  34.73 
 
 
812 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 
692 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
941 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
859 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
917 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  31.68 
 
 
927 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
525 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.72 
 
 
465 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
1359 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  32.71 
 
 
520 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
723 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
730 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  28.61 
 
 
438 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
723 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
723 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  31.05 
 
 
417 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0317  sensor histidine kinase  28.75 
 
 
737 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.824856  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
575 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  34.03 
 
 
723 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
1252 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
832 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
698 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0781  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
319 aa  106  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0225241  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
821 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
821 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  34.03 
 
 
821 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>