34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0353 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  848    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  62.85 
 
 
404 aa  512  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  62.99 
 
 
356 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  51.39 
 
 
403 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  48.02 
 
 
407 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  48.47 
 
 
407 aa  358  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  46.92 
 
 
409 aa  358  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  39.8 
 
 
412 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  84.24 
 
 
167 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  37.5 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  35.07 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  36.62 
 
 
409 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  33.84 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  31.98 
 
 
413 aa  228  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  34.09 
 
 
410 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  30.79 
 
 
412 aa  226  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  30.61 
 
 
398 aa  203  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  29.79 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  50.67 
 
 
155 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  45.95 
 
 
169 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  29.75 
 
 
959 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 
947 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  39.44 
 
 
966 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.36 
 
 
976 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  25.17 
 
 
966 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  27.39 
 
 
921 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  31.58 
 
 
924 aa  50.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  25 
 
 
966 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
571 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.95 
 
 
918 aa  47  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
545 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 
549 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
269 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
560 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>