34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0522 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  100 
 
 		 408 aa  850    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  43.28 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  39.81 
 
 		 413 aa  308  9e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  37.09 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  34.9 
 
 		 407 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  31.31 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  33.01 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  34.33 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  32.05 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  33.42 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  31.51 
 
 		 403 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  30.27 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  34.26 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  29.8 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  31.37 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  28.68 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  27.2 
 
 		 398 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  43.33 
 
 		 167 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  42.11 
 
 		 169 aa  92.8  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  38.73 
 
 		 155 aa  90.1  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.39 
 
 		 976 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  24.73 
 
 		 947 aa  56.6  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  28.98 
 
 		 921 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  26.29 
 
 		 966 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  32.73 
 
 		 924 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 571 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.78 
 
 		 918 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  29.63 
 
 		 966 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  39.13 
 
 		 959 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 545 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 560 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 966 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>