33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0585 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  850    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  41.38 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  39.81 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  36.19 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  34.51 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  31.93 
 
 		 407 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  31.67 
 
 		 407 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  32.66 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  33.9 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  31.34 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  29.5 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  31.98 
 
 		 409 aa  227  4e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  31.6 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  30.12 
 
 		 411 aa  219  7e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  30.43 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  28.4 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  27.32 
 
 		 398 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  40.24 
 
 		 167 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  40.28 
 
 		 169 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  44.54 
 
 		 155 aa  99.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  29.95 
 
 		 966 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.32 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 947 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 921 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  27.47 
 
 		 966 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  25.93 
 
 		 959 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.78 
 
 		 976 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 571 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  36.11 
 
 		 924 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  25.14 
 
 		 966 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 545 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>