130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0852 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
350 aa  704    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  63.98 
 
 
362 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  55.75 
 
 
345 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  51.33 
 
 
373 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  39.02 
 
 
424 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  40.5 
 
 
400 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  41.44 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  41.42 
 
 
374 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  41.16 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
334 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  34.04 
 
 
435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  36.47 
 
 
348 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  36.28 
 
 
337 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  32.25 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  36.99 
 
 
334 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  34.76 
 
 
330 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  33.91 
 
 
335 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  36.54 
 
 
346 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  33.13 
 
 
357 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  33.44 
 
 
404 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.94 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.35 
 
 
332 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  28.71 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  28.28 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  37.88 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
275 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  24.77 
 
 
738 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 
273 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  32.85 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
273 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.99 
 
 
1160 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  33.99 
 
 
273 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 
411 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  29.45 
 
 
313 aa  57  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
278 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  24.88 
 
 
479 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  29.01 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 
417 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  28.57 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  28.57 
 
 
439 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
275 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
1172 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.61 
 
 
289 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 
315 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  34.74 
 
 
553 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 
315 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  27.56 
 
 
561 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.78 
 
 
596 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
1180 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.2 
 
 
643 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.38 
 
 
1122 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  26.77 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  32.03 
 
 
462 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.56 
 
 
513 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  27.61 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  27.61 
 
 
684 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  26.95 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.42 
 
 
568 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 
1156 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.43 
 
 
577 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 
426 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.64 
 
 
1055 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
1094 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  27.06 
 
 
355 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.8 
 
 
226 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  33.71 
 
 
607 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  25.6 
 
 
443 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.67 
 
 
611 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  29.45 
 
 
395 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
1142 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 
270 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
642 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
664 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  23.89 
 
 
1075 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  24.72 
 
 
1046 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  26.8 
 
 
275 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  25.3 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
536 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  23.24 
 
 
591 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  24.87 
 
 
1133 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  25.38 
 
 
1130 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>