160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3937 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
334 aa  664    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  68.6 
 
 
336 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  51.7 
 
 
348 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  48.14 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  48.92 
 
 
330 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  44.94 
 
 
346 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  41.54 
 
 
435 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  39.76 
 
 
424 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  46.45 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  39.94 
 
 
374 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  36.84 
 
 
335 aa  198  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  38.94 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  39.7 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  37.15 
 
 
337 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  37.27 
 
 
400 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  40.06 
 
 
348 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  35.84 
 
 
379 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
350 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.14 
 
 
371 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  37.46 
 
 
373 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 
345 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  34.01 
 
 
404 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.65 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 
364 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  29.9 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
369 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 
373 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  28.66 
 
 
397 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
373 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
373 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
373 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  26.3 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
273 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.34 
 
 
577 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  32.05 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 
275 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.96 
 
 
643 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  30.34 
 
 
536 aa  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  35.48 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.3 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  34.51 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
417 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  29.69 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  30.25 
 
 
471 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.08 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
1046 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  27.15 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
304 aa  53.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  26.9 
 
 
513 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
203 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  32.19 
 
 
310 aa  52.8  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.47 
 
 
611 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
597 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.26 
 
 
1065 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  30.15 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
468 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.06 
 
 
518 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 
468 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  27.21 
 
 
553 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  20 
 
 
591 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 
642 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.17 
 
 
1087 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.93 
 
 
629 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 
1138 aa  49.7  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.15 
 
 
308 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  27.89 
 
 
684 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  23.77 
 
 
515 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  25.93 
 
 
518 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.05 
 
 
1139 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 
1105 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.92 
 
 
631 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  27.31 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 
594 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
652 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  23.94 
 
 
1207 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 
1180 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
647 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  32.86 
 
 
1134 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 
348 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  30.28 
 
 
1358 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
1198 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 
1048 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.66 
 
 
622 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.17 
 
 
431 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.29 
 
 
588 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
1093 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.62 
 
 
1081 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  30.47 
 
 
603 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>