More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12240 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  32.4 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  32.04 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 337 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  33.99 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  33.45 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  32.88 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  32.53 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.82 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  31.39 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.86 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  27.97 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  27.64 
 
 		 379 aa  96.3  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  29.39 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 		 345 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  30.93 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  30.25 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  28.97 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  32.83 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 		 822 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  32.54 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 		 1180 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 1156 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.4 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 		 1172 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  36.62 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  28.01 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  31.52 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.76 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 		 1094 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  34.51 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.53 
 
 		 879 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  29.89 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.03 
 
 		 815 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  32.39 
 
 		 1142 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.13 
 
 		 725 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 		 1089 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  35.15 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 216 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  38.06 
 
 		 273 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  37.79 
 
 		 1096 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  27.87 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  27.65 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  24.68 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.03 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  33.52 
 
 		 971 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.68 
 
 		 1285 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 		 1093 aa  62.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  28.73 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 		 526 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  30.08 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  33.73 
 
 		 273 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.62 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  27.71 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  27.54 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  28.32 
 
 		 817 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.22 
 
 		 981 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  30.34 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  27.69 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 561 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  26.98 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.14 
 
 		 1149 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  28.89 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.01 
 
 		 735 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.67 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  31 
 
 		 1204 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 		 969 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>