135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1285 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
424 aa  836    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  90.44 
 
 
374 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  58.71 
 
 
379 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  43.14 
 
 
362 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  42.16 
 
 
373 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  39.02 
 
 
350 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  38.24 
 
 
400 aa  235  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  39.31 
 
 
345 aa  233  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  39.52 
 
 
348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  40.3 
 
 
336 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  39.76 
 
 
334 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  42.33 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  40.96 
 
 
364 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  36.39 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  39.4 
 
 
346 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  36.83 
 
 
330 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  36.6 
 
 
404 aa  195  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  38.99 
 
 
357 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  37.61 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 
337 aa  164  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.87 
 
 
371 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.59 
 
 
332 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
373 aa  106  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 
369 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 
373 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  27.37 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
273 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 
273 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  26.81 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  26.02 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
273 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.71 
 
 
226 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  28.98 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  31.13 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 
1046 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 
1027 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 
1027 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  31.16 
 
 
304 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  31.28 
 
 
1027 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 
479 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.82 
 
 
289 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  29.11 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  37.21 
 
 
667 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 
738 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.1 
 
 
1087 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.83 
 
 
643 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.74 
 
 
629 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
642 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 
275 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  24.79 
 
 
294 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.36 
 
 
596 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  29.66 
 
 
308 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 
301 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.06 
 
 
1055 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  30.5 
 
 
684 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  25.17 
 
 
279 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 
1392 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
1105 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.71 
 
 
723 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 
261 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
203 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  24.87 
 
 
422 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  26.87 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.87 
 
 
622 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 
664 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
275 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.33 
 
 
622 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.23 
 
 
308 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.46 
 
 
577 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 
1065 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.17 
 
 
1377 aa  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  25.33 
 
 
263 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  31.93 
 
 
553 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  26.86 
 
 
310 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 
1142 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  21.83 
 
 
591 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  27.06 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  28.19 
 
 
607 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
275 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.92 
 
 
598 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.09 
 
 
631 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 
1160 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.7 
 
 
1123 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4719  putative adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 
312 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.742577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>