More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1349 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1349  sensor protein  100 
 
 		 574 aa  1159    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0628361 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.2 
 
 		 591 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3112  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 1029 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  30.94 
 
 		 619 aa  90.5  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  28.44 
 
 		 1361 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1362 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  28 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  25.59 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 		 699 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1076  sensor protein  41.18 
 
 		 630 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  27.85 
 
 		 574 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  19.71 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  21.43 
 
 		 810 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.23 
 
 		 730 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.292082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  18.99 
 
 		 1212 aa  67.4  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22 
 
 		 726 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.386076  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 278 aa  67  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  20.42 
 
 		 626 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  29.92 
 
 		 817 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.35 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  20.74 
 
 		 1374 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.41 
 
 		 737 aa  64.3  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1096  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.59 
 
 		 730 aa  63.9  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  23.72 
 
 		 612 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2079  putative sensor with HAMP domain protein  22.73 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  24.69 
 
 		 699 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31 
 
 		 731 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00776306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.04 
 
 		 823 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.91 
 
 		 815 aa  62  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  21.55 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1055  diguanylate cyclase  21.61 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  24.63 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 822 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.22 
 
 		 819 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  23.89 
 
 		 636 aa  60.5  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.53 
 
 		 1356 aa  60.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3304  sensor histidine kinase BaeS  28.32 
 
 		 514 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.45 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  24 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  26.56 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 607 aa  60.1  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 613 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  25.14 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  21.98 
 
 		 674 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  22.26 
 
 		 1119 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  25.14 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  22.56 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2305  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 1877 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  20.66 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  32.88 
 
 		 583 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.07 
 
 		 654 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  29.66 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  20.66 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  20.66 
 
 		 540 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  27.83 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2144  sensor histidine kinase  41.54 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0559  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.46 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  19 
 
 		 630 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.63 
 
 		 628 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 389 aa  57  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 618 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1002  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  23.21 
 
 		 1100 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 614 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.39 
 
 		 639 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 590 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 785 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 496 aa  56.6  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.32 
 
 		 731 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.395516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.13 
 
 		 524 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  23.79 
 
 		 829 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.27 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  21.94 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  21.94 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  21.94 
 
 		 528 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.08 
 
 		 1177 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  36.76 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  38.03 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 471 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1728  histidine kinase  25.55 
 
 		 346 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 489 aa  54.7  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 448 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3944  Serine/threonine protein kinase-like  30.48 
 
 		 700 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.147415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 829 aa  54.7  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1411  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.46 
 
 		 698 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>