103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0100 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1418  hypothetical protein  81.65 
 
 		 643 aa  1069    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.070904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1308    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6503  transcriptional regulator, SARP family  43.66 
 
 		 649 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 612 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3207  transcriptional regulator, SARP family  38.14 
 
 		 615 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  28.22 
 
 		 641 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  26.93 
 
 		 650 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.05 
 
 		 596 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.58 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.94 
 
 		 598 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  27.47 
 
 		 531 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.57 
 
 		 588 aa  99  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25 
 
 		 631 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  25.63 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.33 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.07 
 
 		 568 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.3 
 
 		 643 aa  79.7  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  26.02 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.66 
 
 		 738 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.81 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  23.68 
 
 		 647 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  25.78 
 
 		 502 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.83 
 
 		 769 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  22.65 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  24.81 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  23.7 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  26.2 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 518 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.32 
 
 		 622 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2399  hypothetical protein  23.98 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797611  hitchhiker  0.00673398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.05 
 
 		 624 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.59 
 
 		 798 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  24.4 
 
 		 581 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.69 
 
 		 658 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.93 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.9 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  23.77 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  29.91 
 
 		 515 aa  62  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.62 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 		 664 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.51 
 
 		 622 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  23.65 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  23.21 
 
 		 686 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.78 
 
 		 737 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  23.33 
 
 		 525 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  25.06 
 
 		 652 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.51 
 
 		 757 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  26.61 
 
 		 521 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 289 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  22.67 
 
 		 527 aa  54.3  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.82 
 
 		 736 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 637 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  23.78 
 
 		 667 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  24.71 
 
 		 531 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  20.7 
 
 		 821 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1383  putative adenylate cyclase  23.67 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  22.25 
 
 		 607 aa  51.2  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.03 
 
 		 822 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0043  transcriptional regulator domain-containing protein  29.32 
 
 		 543 aa  50.4  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.930122 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 685 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 909 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 612 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.69 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.75 
 
 		 810 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 2262 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 878 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20.13 
 
 		 1154 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 597 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.36 
 
 		 521 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 583 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  30 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  23.91 
 
 		 865 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 1737 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.5 
 
 		 832 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.93 
 
 		 816 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 607 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  29.06 
 
 		 594 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.03 
 
 		 1694 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 754 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 505 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6958  hypothetical protein  21.05 
 
 		 600 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 486 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  21.79 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 2262 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.1 
 
 		 247 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 235 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  30.08 
 
 		 636 aa  44.3  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 602 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5105  hypothetical protein  20.97 
 
 		 603 aa  44.3  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 649 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>