108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6503 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6503  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 649 aa  1300    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1418  hypothetical protein  44.94 
 
 		 643 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.070904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0100  hypothetical protein  44.43 
 
 		 643 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3207  transcriptional regulator, SARP family  45.93 
 
 		 615 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2213  SARP family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 612 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226859  normal  0.3766 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  28.7 
 
 		 650 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  28.31 
 
 		 641 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.12 
 
 		 596 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 636 aa  87.8  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.08 
 
 		 588 aa  85.9  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.79 
 
 		 598 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.94 
 
 		 568 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.43 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.19 
 
 		 769 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.21 
 
 		 595 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1418  transcriptional regulator domain protein  25.24 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.06 
 
 		 631 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.13 
 
 		 738 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.6 
 
 		 582 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  26.01 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 580 aa  74.3  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.81 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5608  transcriptional regulator, CadC  25.74 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1779  transcriptional regulator domain protein  25.49 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.304542  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  24.44 
 
 		 821 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.24 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3669  transcriptional regulatory protein-like  28.29 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22 
 
 		 798 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1952  tetratricopeptide TPR_2  24.17 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  0.0284663 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  22.81 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.82 
 
 		 648 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  25.06 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  23.41 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.87 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4563  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.16 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3222  transcriptional regulator domain-containing protein  24.63 
 
 		 531 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0589938  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 		 632 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  22.68 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  22.93 
 
 		 521 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  24.45 
 
 		 581 aa  55.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.67 
 
 		 658 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5779  tetratricopeptide TPR_4  23.67 
 
 		 594 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  22.84 
 
 		 642 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  26.13 
 
 		 479 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 810 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0600  SARP family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  24.76 
 
 		 607 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 878 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 597 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.2 
 
 		 634 aa  50.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  25.11 
 
 		 550 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 612 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 583 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5145  hypothetical protein  24.49 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 636 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  32.35 
 
 		 560 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  23.36 
 
 		 647 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  24.93 
 
 		 667 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 916 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4485  transcriptional regulator, CadC  25 
 
 		 520 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0188012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  27.67 
 
 		 566 aa  47.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.4 
 
 		 816 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 2262 aa  47.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  22.03 
 
 		 522 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0645  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 470 aa  47.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.82 
 
 		 585 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 681 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 213 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 199 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.67 
 
 		 629 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  34.52 
 
 		 725 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.82 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 909 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3721  transcriptional regulatory protein-like  28.08 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 284 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.25 
 
 		 622 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 450 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 886 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 366 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 518 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 1319 aa  45.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.45 
 
 		 573 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 1421 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 279 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 828 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  31.71 
 
 		 1071 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1276 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 828 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 421 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 611 aa  45.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1069 aa  44.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 927 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.93 
 
 		 875 aa  44.3  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 584 aa  44.3  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.68 
 
 		 739 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  21.24 
 
 		 647 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>