178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3019 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2975  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
333 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.931348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3019  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
333 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  98.18 
 
 
275 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  73.36 
 
 
270 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  70.85 
 
 
301 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  60.27 
 
 
316 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2490  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.74 
 
 
277 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  37.3 
 
 
275 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  39.55 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  39.55 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  38.81 
 
 
279 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  32.88 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  36.5 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  29.85 
 
 
425 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  40 
 
 
568 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2321  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.64 
 
 
568 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154208  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 
471 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
597 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4092  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
271 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4168  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
271 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.697513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4322  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.15 
 
 
577 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  31.51 
 
 
216 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  31.33 
 
 
684 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  30.05 
 
 
397 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  33.74 
 
 
536 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  33.54 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 
369 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  27.55 
 
 
513 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 
1160 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  36.69 
 
 
652 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 
626 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.6 
 
 
584 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
373 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.08 
 
 
584 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  31.85 
 
 
462 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.49 
 
 
643 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 
647 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  29.01 
 
 
518 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.79 
 
 
648 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
388 aa  53.9  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  29.01 
 
 
515 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  25.96 
 
 
1392 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  27.85 
 
 
1128 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
622 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 
405 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.17 
 
 
1134 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 
348 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  33.83 
 
 
261 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  31.25 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 
435 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
531 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.73 
 
 
1180 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  25.58 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  24.85 
 
 
665 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 
642 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  34.35 
 
 
263 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  29.63 
 
 
729 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  28.28 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  28.7 
 
 
1198 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 
1156 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  30.54 
 
 
680 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
1204 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4808  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
468 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.357297  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  23.56 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 
1172 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.66 
 
 
595 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.89 
 
 
725 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
633 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.85 
 
 
598 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
647 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  25.16 
 
 
546 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 
411 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.26 
 
 
723 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 
664 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  23.76 
 
 
701 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4898  adenylate/guanylate cyclase  25.5 
 
 
468 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.676801  normal  0.369853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
472 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
482 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45310  predicted protein  23.74 
 
 
780 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.17 
 
 
1020 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.54 
 
 
611 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>