248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38549 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  42.71 
 
 
1773 aa  798    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  41.18 
 
 
1987 aa  863    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  39.43 
 
 
1169 aa  754    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  48.43 
 
 
816 aa  751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  35.58 
 
 
1165 aa  659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  39.81 
 
 
1198 aa  790    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  39.27 
 
 
1196 aa  828    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  100 
 
 
1128 aa  2348    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  43.5 
 
 
868 aa  602  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  49.5 
 
 
1003 aa  584  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  38.94 
 
 
806 aa  458  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45310  predicted protein  34.93 
 
 
780 aa  389  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40689  predicted protein  55.52 
 
 
296 aa  334  7.000000000000001e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_4823  predicted protein  64.14 
 
 
145 aa  195  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121915  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48345  predicted protein  48.04 
 
 
167 aa  181  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  38.86 
 
 
351 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  33.22 
 
 
426 aa  135  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  37.17 
 
 
1207 aa  131  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  40.31 
 
 
531 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  35.68 
 
 
381 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  38.5 
 
 
395 aa  124  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
355 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
435 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 
1209 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  36.89 
 
 
417 aa  119  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
439 aa  119  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  35.29 
 
 
439 aa  119  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  34.8 
 
 
439 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 
395 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  34.8 
 
 
443 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.93 
 
 
1075 aa  111  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 
396 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
520 aa  108  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.47 
 
 
431 aa  105  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 
421 aa  101  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 
407 aa  95.5  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
422 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 
1093 aa  74.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 
1204 aa  71.6  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.02 
 
 
487 aa  70.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  31.32 
 
 
518 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  30.17 
 
 
701 aa  69.3  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.46 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
1285 aa  68.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.07 
 
 
701 aa  68.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 
665 aa  68.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.61 
 
 
701 aa  67.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  31.37 
 
 
1134 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
1156 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  28.28 
 
 
911 aa  65.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
607 aa  65.1  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.92 
 
 
735 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.34 
 
 
701 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
320 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
320 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
1139 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.49 
 
 
1141 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.41 
 
 
1014 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 
1138 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.19 
 
 
637 aa  62.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
546 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.86 
 
 
695 aa  62.4  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2195  adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 
255 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.21 
 
 
1291 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 
643 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.59 
 
 
725 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  26.97 
 
 
513 aa  61.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.21 
 
 
1180 aa  61.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 
536 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
437 aa  60.1  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 
421 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 
713 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  30.97 
 
 
684 aa  59.3  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  27.12 
 
 
717 aa  59.3  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.03 
 
 
577 aa  59.3  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.89 
 
 
758 aa  58.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.87 
 
 
1226 aa  58.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  27.01 
 
 
741 aa  58.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.33 
 
 
757 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2493  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
255 aa  58.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 
284 aa  57.4  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 
1151 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 
1148 aa  56.6  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 
864 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 
1172 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.68 
 
 
1151 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 
1198 aa  57.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 
746 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.64 
 
 
1055 aa  57.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.82 
 
 
694 aa  56.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25.91 
 
 
758 aa  56.2  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.83 
 
 
1160 aa  56.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
658 aa  56.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.09 
 
 
1055 aa  56.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
651 aa  55.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  32.45 
 
 
645 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>