More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7171 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 76 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 359 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  56.67 
 
 		 372 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 368 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  56.6 
 
 		 295 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  43.33 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  60.42 
 
 		 344 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 918 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 894 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  48.39 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 919 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 881 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  50 
 
 		 913 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 881 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 876 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  49.02 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  52.83 
 
 		 893 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  52.94 
 
 		 884 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 882 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 937 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 937 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 937 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  56.82 
 
 		 911 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0703  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 220 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 938 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 835 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 956 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  56.82 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 960 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 1000 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  56.52 
 
 		 904 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 492 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  48.15 
 
 		 337 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  55.1 
 
 		 959 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 966 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 886 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  43.86 
 
 		 940 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.36 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 270 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  51.11 
 
 		 680 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.11 
 
 		 981 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  58.33 
 
 		 963 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 879 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 910 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 556 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 222 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  50 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  56.82 
 
 		 957 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 930 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.35 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 889 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 903 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  43.86 
 
 		 917 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 221 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  49.02 
 
 		 919 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 940 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3585  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4782  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 251 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 929 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5501  LuxR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.926313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  43.86 
 
 		 827 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 927 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 374 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 950 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  45.83 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4636  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 320 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 995 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  45.83 
 
 		 235 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 374 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 927 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 910 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3488  response regulator receiver  50.98 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.920048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  54.55 
 
 		 955 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.35 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 324 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 799 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>