More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2015 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2015  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
538 aa  1099    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.83 
 
 
651 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  52.48 
 
 
678 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.24 
 
 
662 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.09 
 
 
660 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.96 
 
 
653 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.02 
 
 
642 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.41 
 
 
642 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.52 
 
 
650 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.82 
 
 
639 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.15 
 
 
810 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.65 
 
 
782 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.64 
 
 
789 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.64 
 
 
789 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  47.99 
 
 
650 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.1 
 
 
630 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  48.29 
 
 
699 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.08 
 
 
815 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.63 
 
 
781 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.7 
 
 
807 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
789 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.27 
 
 
766 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
743 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.33 
 
 
774 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  37.78 
 
 
812 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.63 
 
 
508 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.78 
 
 
650 aa  309  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1935  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
386 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487493  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3835  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
386 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
386 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
386 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
387 aa  296  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
657 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
643 aa  286  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
639 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
641 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
657 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
668 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  42.78 
 
 
539 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
657 aa  259  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
806 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 
942 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  35.03 
 
 
1065 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
1065 aa  258  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
632 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
673 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2374  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  46.12 
 
 
693 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2470  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.12 
 
 
693 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000343207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1658  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  46.12 
 
 
693 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000881395  normal  0.485091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1260 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  40.78 
 
 
534 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
936 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1260 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  39.9 
 
 
544 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
979 aa  244  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
957 aa  243  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
695 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
962 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
1050 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1105 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
1050 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
1076 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  34.63 
 
 
1086 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1122 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 
670 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 
1092 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  32.56 
 
 
749 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
1086 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1381 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
916 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
807 aa  233  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
827 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1134 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
943 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  38.05 
 
 
544 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  38.6 
 
 
541 aa  230  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1022 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  39.22 
 
 
533 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  38.6 
 
 
541 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
941 aa  230  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
1053 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  38.96 
 
 
533 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  40.93 
 
 
531 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  37.37 
 
 
533 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
1089 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
688 aa  227  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  46.29 
 
 
588 aa  226  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
682 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  43.51 
 
 
575 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
642 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
766 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
939 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
853 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
818 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1165 aa  223  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
681 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  37.24 
 
 
541 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.47 
 
 
999 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
859 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
492 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>