More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1736 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
387 aa  774    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.93 
 
 
651 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 
653 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2015  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
538 aa  311  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.89 
 
 
508 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.43 
 
 
642 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.63 
 
 
642 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.83 
 
 
766 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.69 
 
 
789 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  44.44 
 
 
678 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.18 
 
 
650 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
662 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 
660 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  45.36 
 
 
699 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  44.18 
 
 
650 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
781 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
782 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 
807 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 
639 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.53 
 
 
650 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.63 
 
 
815 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
789 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
789 aa  279  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 
774 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 
630 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
810 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
386 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3835  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
386 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
386 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1935  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
386 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487493  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
632 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  36.24 
 
 
534 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  35.96 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
673 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
818 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  38.18 
 
 
812 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
743 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  37.12 
 
 
541 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  37.12 
 
 
541 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
655 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  36.84 
 
 
541 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  39.83 
 
 
1225 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
1225 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1076 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1215 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  35.83 
 
 
533 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2505  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
707 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  35.83 
 
 
533 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  35.75 
 
 
544 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  43.12 
 
 
646 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3430  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
705 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  36.24 
 
 
531 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1092 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1165 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1050 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  35.95 
 
 
1086 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
1057 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
769 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1086 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
701 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  41.85 
 
 
701 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  41.95 
 
 
646 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
1067 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
979 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.82 
 
 
728 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
559 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
742 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 
889 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2332  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
687 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  34.25 
 
 
533 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 
1089 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
503 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
941 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
864 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3081  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.48 
 
 
638 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
899 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 
1022 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
849 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  33.88 
 
 
534 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
1095 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
943 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
922 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  40.14 
 
 
676 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
470 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
695 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
845 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 
785 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1105 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
957 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  41.01 
 
 
676 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
553 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
668 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
819 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
688 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 
999 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3375  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
714 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  44.96 
 
 
416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
762 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 
702 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>