More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3204 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
386 aa  791    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  77.98 
 
 
386 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3835  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  77.2 
 
 
386 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1935  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  76.94 
 
 
386 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487493  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.95 
 
 
660 aa  346  4e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  47.43 
 
 
678 aa  345  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.74 
 
 
651 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.05 
 
 
508 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 
653 aa  336  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  47.99 
 
 
650 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.49 
 
 
766 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  45.83 
 
 
699 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 
650 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.65 
 
 
789 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.65 
 
 
789 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 
781 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.3 
 
 
815 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.85 
 
 
774 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.38 
 
 
807 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.47 
 
 
630 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.56 
 
 
662 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.49 
 
 
782 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.79 
 
 
789 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.88 
 
 
642 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
642 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 
810 aa  308  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.88 
 
 
650 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2015  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.84 
 
 
538 aa  300  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
639 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
387 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.513446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
1050 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
743 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
655 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 
688 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
650 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
777 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  37.4 
 
 
812 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
962 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
773 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  46.47 
 
 
564 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  37.64 
 
 
544 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
1106 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1418 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
643 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
673 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
714 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
944 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1134 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
766 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
632 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
699 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
926 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.93 
 
 
1081 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
853 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1132 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  36.97 
 
 
539 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
818 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  34.44 
 
 
541 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  34.44 
 
 
541 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
864 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
628 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
1057 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
773 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
759 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
657 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  33.88 
 
 
541 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  35.25 
 
 
622 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1260 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1059 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 
683 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1076 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
622 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
943 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1148 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
711 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
673 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1260 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
785 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
576 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
806 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  39.32 
 
 
783 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  36.04 
 
 
749 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1105 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
559 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
859 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
677 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
742 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
642 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 
1053 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
722 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1076 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  40.13 
 
 
858 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  42.01 
 
 
575 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
983 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 
795 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576685  normal  0.0880633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
888 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
584 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  43.7 
 
 
552 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  37.89 
 
 
533 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>