More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0349 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
722 aa  1470    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 
712 aa  618  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 
705 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
707 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.73 
 
 
702 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 
704 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  42.62 
 
 
716 aa  505  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4144  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
760 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.02765  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7023  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
763 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180026  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
759 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0137592  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  35.33 
 
 
743 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
758 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5512  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
746 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294754  normal  0.0542916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4959  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
746 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00168647  normal  0.0243136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  35.68 
 
 
768 aa  364  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4548  histidine kinase  35.64 
 
 
749 aa  364  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000713404  normal  0.70634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
764 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5171  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
749 aa  363  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00341574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5688  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
749 aa  363  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00115642  decreased coverage  0.000406473 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 
760 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 
760 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 
767 aa  360  7e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  35.85 
 
 
767 aa  360  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
725 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  35.71 
 
 
760 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  35.58 
 
 
760 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
717 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
701 aa  340  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  49.23 
 
 
564 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
717 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  35.4 
 
 
701 aa  334  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
508 aa  321  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 
722 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
942 aa  312  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  44.31 
 
 
684 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  44.36 
 
 
685 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
821 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 
684 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.07 
 
 
742 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.75 
 
 
1011 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.24 
 
 
899 aa  302  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.26 
 
 
826 aa  301  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.35 
 
 
944 aa  301  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 
809 aa  300  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
1014 aa  300  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
943 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
584 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  44.68 
 
 
490 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.61 
 
 
926 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 
1057 aa  297  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 
662 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.44 
 
 
1059 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  43.91 
 
 
611 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  43.91 
 
 
611 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 
743 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  43.91 
 
 
611 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.25 
 
 
814 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  43.65 
 
 
611 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  43.65 
 
 
611 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 
795 aa  294  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 
611 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
822 aa  293  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  46.19 
 
 
638 aa  293  9e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 
655 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 
686 aa  293  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  43.22 
 
 
580 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
762 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  41.27 
 
 
529 aa  291  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  44.9 
 
 
632 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
589 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
1224 aa  290  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 
783 aa  290  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  44.19 
 
 
936 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  45.99 
 
 
783 aa  290  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 
588 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.25 
 
 
785 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
812 aa  289  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
589 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
575 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  42.6 
 
 
695 aa  287  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.89 
 
 
581 aa  287  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  43.01 
 
 
1427 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 
695 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.11 
 
 
703 aa  286  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  43.9 
 
 
575 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 
946 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
732 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 
589 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 
589 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
585 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
888 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
1076 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
1053 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
827 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 
807 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
946 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
837 aa  283  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
732 aa  283  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
588 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>