More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4788 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  74.09 
 
 
686 aa  923    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  95.86 
 
 
580 aa  1074    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  100 
 
 
685 aa  1360    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  32.84 
 
 
685 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  42.32 
 
 
539 aa  297  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 
712 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
722 aa  295  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  47 
 
 
899 aa  287  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4750  histidine kinase  33.24 
 
 
670 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.1 
 
 
662 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.19 
 
 
943 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 
1011 aa  280  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
1014 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  40.68 
 
 
531 aa  277  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  42.52 
 
 
1427 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 
944 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
707 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
742 aa  274  5.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.93 
 
 
1426 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 
628 aa  273  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  43.21 
 
 
575 aa  272  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
1059 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  42.22 
 
 
533 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
508 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  42.22 
 
 
533 aa  270  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
705 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
1057 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
703 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
575 aa  267  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 
1076 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  44.24 
 
 
638 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
720 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
809 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
822 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  42.23 
 
 
622 aa  264  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
622 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.47 
 
 
785 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  42.53 
 
 
783 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 
826 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 
783 aa  262  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 
732 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  41.21 
 
 
534 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.16 
 
 
807 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
702 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
942 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  38.71 
 
 
544 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.1 
 
 
573 aa  260  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
728 aa  260  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
1415 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 
814 aa  259  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 
622 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
584 aa  259  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 
795 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
722 aa  258  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
1381 aa  257  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 
946 aa  257  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 
888 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  39.5 
 
 
646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
999 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
821 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
1089 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
837 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  42.4 
 
 
564 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
695 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  39.29 
 
 
541 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  39.29 
 
 
541 aa  253  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  41.03 
 
 
681 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
529 aa  253  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
641 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
681 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
640 aa  252  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 
795 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 
795 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576685  normal  0.0880633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
673 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
812 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
704 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  39.49 
 
 
490 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
727 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
957 aa  251  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 
630 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
727 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
701 aa  250  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
682 aa  250  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6621  histidine kinase  39.3 
 
 
552 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  40.25 
 
 
571 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
1013 aa  249  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  39.3 
 
 
552 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  38.69 
 
 
541 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
716 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
683 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
681 aa  248  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  35.36 
 
 
534 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 
926 aa  248  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
720 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 
534 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.77 
 
 
1022 aa  247  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
727 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
548 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  40.05 
 
 
936 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>