More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0006 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4144  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  76.24 
 
 		 760 aa  1183    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.02765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  64.61 
 
 		 767 aa  967    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7023  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  90.69 
 
 		 763 aa  1403    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180026  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4548  histidine kinase  65.21 
 
 		 749 aa  954    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000713404  normal  0.70634 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  66.07 
 
 		 725 aa  952    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  65.34 
 
 		 764 aa  954    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  65.3 
 
 		 768 aa  968    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  64.89 
 
 		 758 aa  950    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 759 aa  1535    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5512  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  65.56 
 
 		 746 aa  959    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294754  normal  0.0542916 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5171  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  65.07 
 
 		 749 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00341574  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4959  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  65.56 
 
 		 746 aa  959    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00168647  normal  0.0243136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5688  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  65.07 
 
 		 749 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00115642  decreased coverage  0.000406473 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  64.61 
 
 		 760 aa  968    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  64.61 
 
 		 767 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  64.64 
 
 		 760 aa  968    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  64.47 
 
 		 760 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  64.61 
 
 		 760 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 		 717 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.79 
 
 		 717 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 728 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 712 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 707 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 722 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 705 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 704 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 702 aa  341  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 716 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  33.61 
 
 		 743 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 701 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  33.8 
 
 		 701 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 754 aa  287  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 		 662 aa  278  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  41.91 
 
 		 564 aa  273  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 762 aa  257  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 889 aa  250  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 673 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 734 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1089 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 640 aa  240  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 1057 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 821 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 728 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  39.75 
 
 		 544 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 943 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 575 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 585 aa  238  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 559 aa  238  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 661 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  36.64 
 
 		 534 aa  238  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 732 aa  237  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  37.39 
 
 		 587 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 587 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  38.69 
 
 		 575 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 1076 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 		 641 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 1022 aa  235  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1011 aa  234  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 1053 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 827 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 708 aa  233  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 703 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 584 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1105 aa  233  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  37.53 
 
 		 558 aa  233  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 611 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 887 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 611 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 611 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.86 
 
 		 1036 aa  232  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 611 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 611 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 943 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  38.2 
 
 		 611 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 741 aa  231  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  37.94 
 
 		 533 aa  231  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  37.95 
 
 		 533 aa  231  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  40 
 
 		 416 aa  231  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  36.01 
 
 		 539 aa  231  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 		 1059 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1076 aa  230  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 1013 aa  230  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  33.97 
 
 		 1005 aa  230  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 922 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 		 795 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  38.8 
 
 		 646 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  37.47 
 
 		 949 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 812 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  35.64 
 
 		 691 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  35.43 
 
 		 691 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 684 aa  228  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 740 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 588 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  37 
 
 		 646 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 806 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 		 999 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 686 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 837 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>