More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1292 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 686 aa  1335    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21073  normal  0.829403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3366  histidine kinase  74.39 
 
 		 580 aa  815    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4788  histidine kinase  74.67 
 
 		 685 aa  971    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  33.38 
 
 		 685 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 		 722 aa  297  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.67 
 
 		 712 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  41.99 
 
 		 533 aa  287  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  41.99 
 
 		 533 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.17 
 
 		 662 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  40.99 
 
 		 539 aa  279  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4750  histidine kinase  32.75 
 
 		 670 aa  276  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.19 
 
 		 1011 aa  276  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 705 aa  275  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 707 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  43.19 
 
 		 1427 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 		 702 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 		 942 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 822 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  45.95 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 		 1014 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 		 1057 aa  266  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  40.5 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 628 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.99 
 
 		 588 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 795 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 		 622 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  42.06 
 
 		 622 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 1426 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  43 
 
 		 681 aa  263  6e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 		 683 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 		 681 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 703 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.33 
 
 		 812 aa  262  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 682 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 		 946 aa  261  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  43.05 
 
 		 564 aa  261  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 		 742 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 1059 aa  260  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 681 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 704 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 807 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 		 673 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 		 837 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 783 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  44.36 
 
 		 783 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 		 720 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 		 943 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 		 809 aa  258  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  40.7 
 
 		 573 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 		 785 aa  257  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 1076 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 508 aa  257  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 		 1415 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 		 622 aa  256  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 641 aa  256  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.16 
 
 		 899 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 		 630 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.62 
 
 		 944 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1076 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 693 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.32 
 
 		 575 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 720 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 732 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 821 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 		 1224 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 826 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  40.1 
 
 		 571 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 946 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 		 722 aa  251  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 926 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  38.61 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  36.61 
 
 		 534 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  42.35 
 
 		 638 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 		 926 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  38.61 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 999 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 814 aa  249  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6621  histidine kinase  39.63 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 		 727 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 943 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4144  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 760 aa  249  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.02765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 1013 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 695 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 		 818 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.48 
 
 		 640 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  38.58 
 
 		 544 aa  247  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  40.15 
 
 		 490 aa  247  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  35.7 
 
 		 534 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1651 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 743 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 888 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  39.57 
 
 		 529 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 1646 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 639 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  40.75 
 
 		 1299 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  39.9 
 
 		 552 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 889 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 		 1022 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>