More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7023 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  66.01 
 
 		 767 aa  976    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  67.4 
 
 		 725 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0010  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  66.05 
 
 		 764 aa  953    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00266104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2366  sensor histidine kinase/response regulator  66.53 
 
 		 768 aa  974    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00256663  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5512  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  66.14 
 
 		 746 aa  955    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0294754  normal  0.0542916 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  90.69 
 
 		 759 aa  1403    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  65.61 
 
 		 758 aa  948    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4144  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  76.89 
 
 		 760 aa  1192    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.02765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5171  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  66.14 
 
 		 749 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00341574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7023  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 763 aa  1540    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180026  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4959  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  66.14 
 
 		 746 aa  955    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00168647  normal  0.0243136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4548  histidine kinase  66.27 
 
 		 749 aa  956    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000713404  normal  0.70634 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5688  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  66.14 
 
 		 749 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00115642  decreased coverage  0.000406473 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  66.01 
 
 		 760 aa  977    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  66.01 
 
 		 767 aa  976    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  66.01 
 
 		 760 aa  978    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  65.88 
 
 		 760 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  66.01 
 
 		 760 aa  977    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.31 
 
 		 717 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5284  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 717 aa  588  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 728 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 712 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 705 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 722 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 707 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 704 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 702 aa  343  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  32.18 
 
 		 716 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  34.15 
 
 		 743 aa  312  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 701 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 754 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  32.87 
 
 		 701 aa  280  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 		 662 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  41.28 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 762 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 673 aa  248  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 889 aa  244  6e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 734 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  38.05 
 
 		 544 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 		 821 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 559 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.1 
 
 		 1036 aa  239  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  35.71 
 
 		 534 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 1053 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 732 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1089 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 887 aa  236  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1105 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 584 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 703 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1076 aa  234  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 585 aa  234  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 949 aa  234  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  35.7 
 
 		 539 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 943 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 1057 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 812 aa  232  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 922 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 943 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 1011 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  37.06 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 826 aa  230  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1059 aa  230  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 640 aa  230  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  36.84 
 
 		 949 aa  230  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 795 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 703 aa  229  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 		 641 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 661 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  37.75 
 
 		 571 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 827 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  37.03 
 
 		 558 aa  229  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 1022 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 		 1076 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 740 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  38.11 
 
 		 575 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 1651 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  36.78 
 
 		 646 aa  227  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 708 aa  227  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 1014 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  39.17 
 
 		 638 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 809 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 		 814 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 822 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1631 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 622 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 728 aa  226  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  34.49 
 
 		 533 aa  226  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 830 aa  224  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  31.23 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  31.23 
 
 		 541 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  34.24 
 
 		 691 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 		 899 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 630 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  34.17 
 
 		 533 aa  224  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 926 aa  224  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>