More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00708 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  100 
 
 
358 aa  714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  53.2 
 
 
357 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  55.31 
 
 
382 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  49.24 
 
 
356 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.64 
 
 
351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  49.35 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0037  sensor histidine kinase  49.03 
 
 
337 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  46.91 
 
 
355 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  45.68 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  41.99 
 
 
406 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  42.74 
 
 
1833 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  44.26 
 
 
1845 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
975 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
640 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
739 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
875 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
713 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
1000 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  43.1 
 
 
1822 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
484 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
978 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 
733 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
515 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
632 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
632 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
632 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  41.07 
 
 
225 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
851 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
803 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
1211 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  34.38 
 
 
1712 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
963 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
729 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
886 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
636 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
796 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
657 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  32.98 
 
 
1697 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
845 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
748 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
495 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
501 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
494 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  38.79 
 
 
1837 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
902 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
538 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
510 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
510 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  38.46 
 
 
1744 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
508 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
666 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
369 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
773 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  41.67 
 
 
512 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
513 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
1211 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
515 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
779 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
515 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
759 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
398 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  36.64 
 
 
1836 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
630 aa  149  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
512 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
511 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  36.36 
 
 
1685 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
500 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
471 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
799 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
548 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
553 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
519 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  37.11 
 
 
548 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
635 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2452  multisensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
556 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
548 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2126  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
848 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
848 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.816658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2094  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1551  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
529 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573003  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
648 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  32.54 
 
 
1682 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
461 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  36.24 
 
 
635 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
527 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
839 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1718  PAS sensor protein  34.88 
 
 
811 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.604616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
513 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
632 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  36.9 
 
 
758 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
634 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3795  histidine kinase  34.69 
 
 
610 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>