More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1613 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 550 aa  1055    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 		 590 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 		 571 aa  339  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  47.19 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  38.62 
 
 		 572 aa  278  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 567 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 568 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  36.66 
 
 		 591 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.01 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 544 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  37.21 
 
 		 573 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 580 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 573 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 565 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 592 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  36.18 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 588 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 543 aa  203  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 595 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  34.78 
 
 		 536 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 631 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  34.54 
 
 		 578 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 579 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 556 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 566 aa  183  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 559 aa  179  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 578 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 568 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 568 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 568 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 568 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  33.21 
 
 		 573 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 575 aa  157  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  31.46 
 
 		 549 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  35.18 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  36.19 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  33.19 
 
 		 543 aa  144  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  30.93 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  29.84 
 
 		 635 aa  114  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 381 aa  113  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 372 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 392 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 421 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  39.07 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.62 
 
 		 851 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 665 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 386 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 373 aa  87  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  29.65 
 
 		 673 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  31.73 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 682 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.44 
 
 		 594 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  29.3 
 
 		 828 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 960 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 725 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.98 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.98 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  34.29 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2300  nitrate/nitrite sensor protein NarX  23.61 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 462 aa  67  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 462 aa  67  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  29.04 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1631 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2224  nitrate/nitrite sensor protein NarX  23.83 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129909  normal  0.0788983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.14 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  25.98 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  26.04 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  29.84 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  32.04 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  24.1 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3054  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  28.1 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  29.31 
 
 		 622 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  30.99 
 
 		 740 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 552 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 775 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.47 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  25.63 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  29.73 
 
 		 622 aa  62  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.39 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.39 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.13 
 
 		 952 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.48 
 
 		 583 aa  60.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>